MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 1229

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	AT	3	6	10	15	50 %	50 %	0 %	0 %	152998484
2	NC_009661	CTA	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998484
3	NC_009661	A	7	7	23	29	100 %	0 %	0 %	0 %	152998484
4	NC_009661	GA	3	6	59	64	50 %	0 %	50 %	0 %	152998484
5	NC_009661	T	6	6	73	78	0 %	100 %	0 %	0 %	152998484
6	NC_009661	AT	3	6	115	120	50 %	50 %	0 %	0 %	152998484
7	NC_009661	AAG	2	6	135	140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998484
8	NC_009661	TTA	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998484
9	NC_009661	AGA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998484
10	NC_009661	A	6	6	275	280	100 %	0 %	0 %	0 %	152998484
11	NC_009661	TGT	2	6	337	342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998484
12	NC_009661	TG	3	6	457	462	0 %	50 %	50 %	0 %	152998485
13	NC_009661	ACAGGA	2	12	538	549	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	152998485
14	NC_009661	GTG	2	6	569	574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998485
15	NC_009661	ATT	2	6	597	602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998485
16	NC_009661	GCAGAT	2	12	607	618	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152998485
17	NC_009661	TTAT	2	8	669	676	25 %	75 %	0 %	0 %	152998485
18	NC_009661	TGC	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998485
19	NC_009661	AAC	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998485
20	NC_009661	AAAC	2	8	756	763	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
21	NC_009661	CCT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998485
22	NC_009661	GTT	2	6	915	920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998485
23	NC_009661	AAC	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998485
24	NC_009661	AAAC	2	8	1034	1041	75 %	0 %	0 %	25 %	152998485
25	NC_009661	TCC	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998485
26	NC_009661	AAGA	2	8	1098	1105	75 %	0 %	25 %	0 %	152998485
27	NC_009661	ACA	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998485
28	NC_009661	TGAAA	2	10	1164	1173	60 %	20 %	20 %	0 %	152998485
29	NC_009661	GAT	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998485
30	NC_009661	GAA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998485
31	NC_009661	CCT	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152998485
32	NC_009661	TGC	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998485
33	NC_009661	GGTT	2	8	1346	1353	0 %	50 %	50 %	0 %	152998485
34	NC_009661	GAATC	2	10	1359	1368	40 %	20 %	20 %	20 %	152998485
35	NC_009661	GAA	3	9	2355	2363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998486
36	NC_009661	AG	4	8	2366	2373	50 %	0 %	50 %	0 %	152998486
37	NC_009661	CCA	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998486
38	NC_009661	GGT	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998486
39	NC_009661	TAC	2	6	2474	2479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998486
40	NC_009661	TA	4	8	2498	2505	50 %	50 %	0 %	0 %	152998486
41	NC_009661	TGA	2	6	2506	2511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998486
42	NC_009661	GAAT	2	8	2555	2562	50 %	25 %	25 %	0 %	152998486
43	NC_009661	A	6	6	2574	2579	100 %	0 %	0 %	0 %	152998486
44	NC_009661	AT	3	6	2604	2609	50 %	50 %	0 %	0 %	152998486
45	NC_009661	GA	3	6	2613	2618	50 %	0 %	50 %	0 %	152998486
46	NC_009661	TGC	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998486
47	NC_009661	TGC	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998486
48	NC_009661	A	7	7	2690	2696	100 %	0 %	0 %	0 %	152998486
49	NC_009661	ATA	2	6	2701	2706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998486
50	NC_009661	TACT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
51	NC_009661	ATT	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998486
52	NC_009661	TTA	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998486
53	NC_009661	ATG	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998486
54	NC_009661	TTA	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998486
55	NC_009661	TCAT	2	8	2933	2940	25 %	50 %	0 %	25 %	152998486
56	NC_009661	GCT	2	6	3227	3232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998487
57	NC_009661	AGT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998487
58	NC_009661	TCT	2	6	3397	3402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998487
59	NC_009661	ATC	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998487
60	NC_009661	ATCA	2	8	3439	3446	50 %	25 %	0 %	25 %	152998487
61	NC_009661	TCAG	2	8	3452	3459	25 %	25 %	25 %	25 %	152998487
62	NC_009661	TTC	2	6	3481	3486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998487
63	NC_009661	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998487
64	NC_009661	ACTT	2	8	3555	3562	25 %	50 %	0 %	25 %	152998487
65	NC_009661	GC	3	6	3791	3796	0 %	0 %	50 %	50 %	152998487
66	NC_009661	GATTGA	2	12	4067	4078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998488
67	NC_009661	GTT	2	6	4119	4124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998488
68	NC_009661	TTTA	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	152998488
69	NC_009661	TGA	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998488
70	NC_009661	GAA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998488
71	NC_009661	AGA	2	6	4310	4315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998488
72	NC_009661	TGT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998489
73	NC_009661	TTC	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998489
74	NC_009661	CTA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998489
75	NC_009661	TAG	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998489
76	NC_009661	TCACTA	2	12	5179	5190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998489
77	NC_009661	AATA	2	8	5205	5212	75 %	25 %	0 %	0 %	152998489
78	NC_009661	ATTG	2	8	5220	5227	25 %	50 %	25 %	0 %	152998489
79	NC_009661	CTT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998489
80	NC_009661	T	6	6	5361	5366	0 %	100 %	0 %	0 %	152998489
81	NC_009661	GTT	2	6	5436	5441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998489
82	NC_009661	TAA	2	6	5492	5497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998490
83	NC_009661	TGT	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998490
84	NC_009661	AATTG	2	10	5610	5619	40 %	40 %	20 %	0 %	152998490
85	NC_009661	TTTTAG	2	12	5635	5646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	152998490
86	NC_009661	CT	3	6	5651	5656	0 %	50 %	0 %	50 %	152998490
87	NC_009661	CAC	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998490
88	NC_009661	GCTT	2	8	5712	5719	0 %	50 %	25 %	25 %	152998490
89	NC_009661	TTG	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998490
90	NC_009661	CAC	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998490
91	NC_009661	GT	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	152998490
92	NC_009661	CAA	2	6	5824	5829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152998490
93	NC_009661	TACC	2	8	6001	6008	25 %	25 %	0 %	50 %	152998490
94	NC_009661	TAT	2	6	6730	6735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998491
95	NC_009661	TA	3	6	6749	6754	50 %	50 %	0 %	0 %	152998491
96	NC_009661	AGT	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998491
97	NC_009661	TGT	2	6	6797	6802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998491
98	NC_009661	GA	3	6	6915	6920	50 %	0 %	50 %	0 %	152998491
99	NC_009661	TTTA	2	8	6990	6997	25 %	75 %	0 %	0 %	152998491
100	NC_009661	TCT	2	6	7007	7012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998491
101	NC_009661	GAA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998492
102	NC_009661	GGAA	2	8	7562	7569	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
103	NC_009661	AGA	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998492
104	NC_009661	TGA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998492
105	NC_009661	GAAA	2	8	7665	7672	75 %	0 %	25 %	0 %	152998492
106	NC_009661	A	6	6	7677	7682	100 %	0 %	0 %	0 %	152998492
107	NC_009661	CTT	2	6	7692	7697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998492
108	NC_009661	GA	3	6	7701	7706	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
109	NC_009661	TCA	2	6	7726	7731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998492
110	NC_009661	GAA	2	6	7916	7921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152998492
111	NC_009661	AAGG	2	8	7929	7936	50 %	0 %	50 %	0 %	152998492
112	NC_009661	TCGT	2	8	7957	7964	0 %	50 %	25 %	25 %	152998492
113	NC_009661	GTGAC	2	10	8107	8116	20 %	20 %	40 %	20 %	152998492
114	NC_009661	GTG	2	6	8154	8159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152998492
115	NC_009661	TAA	2	6	8236	8241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998492
116	NC_009661	GTT	2	6	8391	8396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998492
117	NC_009661	CAAC	2	8	8445	8452	50 %	0 %	0 %	50 %	152998492
118	NC_009661	T	6	6	8703	8708	0 %	100 %	0 %	0 %	152998493
119	NC_009661	TTC	2	6	8714	8719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998493
120	NC_009661	CAC	2	6	8728	8733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152998493
121	NC_009661	T	7	7	8747	8753	0 %	100 %	0 %	0 %	152998493
122	NC_009661	CTA	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998493
123	NC_009661	CA	3	6	8805	8810	50 %	0 %	0 %	50 %	152998493
124	NC_009661	TAAA	2	8	8837	8844	75 %	25 %	0 %	0 %	152998493
125	NC_009661	ATT	2	6	8855	8860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998493
126	NC_009661	AATG	2	8	8864	8871	50 %	25 %	25 %	0 %	152998493
127	NC_009661	TAG	2	6	8880	8885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998493
128	NC_009661	TCT	2	6	8937	8942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998493
129	NC_009661	TTCA	2	8	8951	8958	25 %	50 %	0 %	25 %	152998493
130	NC_009661	ATT	2	6	9141	9146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152998493
131	NC_009661	ATTACT	2	12	9155	9166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	152998493
132	NC_009661	TGA	2	6	9171	9176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998493
133	NC_009661	AAGC	2	8	9239	9246	50 %	0 %	25 %	25 %	152998493
134	NC_009661	AAT	2	6	9305	9310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152998493
135	NC_009661	T	6	6	9324	9329	0 %	100 %	0 %	0 %	152998493
136	NC_009661	TGA	2	6	9333	9338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152998493
137	NC_009661	T	6	6	9357	9362	0 %	100 %	0 %	0 %	152998493
138	NC_009661	TTG	2	6	9415	9420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998493
139	NC_009661	T	7	7	9455	9461	0 %	100 %	0 %	0 %	152998493
140	NC_009661	T	7	7	9515	9521	0 %	100 %	0 %	0 %	152998493
141	NC_009661	TTG	2	6	9549	9554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998493
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249	NC_009661	AAGA	2	8	18792	18799	75 %	0 %	25 %	0 %	152998502
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263	NC_009661	TCT	2	6	19698	19703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152998503
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266	NC_009661	TTG	2	6	19824	19829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998503
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268	NC_009661	AATA	2	8	19970	19977	75 %	25 %	0 %	0 %	152998503
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274	NC_009661	AGCG	2	8	20090	20097	25 %	0 %	50 %	25 %	152998503
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395	NC_009661	GTT	2	6	30347	30352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152998511
396	NC_009661	CGC	2	6	30406	30411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152998511
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399	NC_009661	ATC	2	6	31090	31095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998512
400	NC_009661	TGC	2	6	31115	31120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152998512
401	NC_009661	TAC	2	6	31160	31165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152998512
402	NC_009661	GC	4	8	31179	31186	0 %	0 %	50 %	50 %	152998512
403	NC_009661	A	7	7	31188	31194	100 %	0 %	0 %	0 %	152998512
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